สำนักงานรัฐมนตรี (Office of the Minister) เป็นหน่วยงานในสังกัดกระทรวงศึกษาธิการ มีเลขานุการรัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ (ข้าราชการการเมือง) เป็นผู้บังคับบัญชา สำนักงานนี้ขึ้นตรงต่อรัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ จัดตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 1 พฤษภาคม 2476
เรียกว่า “กรมเลขานุการรัฐมนตรี”

9 ธันวาคม 2476 ได้เปลี่ยนชื่อเป็นสำนักงานเลขานุการรัฐมนตรี มีฐานะเทียบเท่ากรม

2515 ประกาศคณะปฏิวัติฉบับที่ 216, 218 ให้มีฐานะเป็นหน่วยงานหนึ่งของกระทรวงศึกษาธิการ การแบ่งส่วนราชการปรากฏอยู่ใน
พระราชกฤษฎีกาจัดงานระเบียบราชการสำนักงานเลขานุการรัฐมนตรี

2520 ได้มีการกำหนดตำแหน่งหัวหน้าสำนักงานเลขานุการรัฐมนตรี แบ่งส่วนราชการออกเป็น 2 ฝ่าย ได้แก่
1. แผนกการเมือง
2. แผนกตรวจสอบเรื่องราวและความเห็น

2533 ได้ขยายภารกิจเพิ่มขึ้น แบ่งส่วนราชการออกเป็น 2 ฝ่าย 6 งาน ได้แก่
1. ฝ่ายบริหารงานทั่วไป แบ่งออกเป็น 3 งาน
1.1 งานสารบรรณ
1.2 งานตรวจสอบ
1.3 งานวิเทศสัมพันธ์และสื่อสารมวลชน
2. ฝ่ายการเมืองและประสานนโยบาย แบ่งออกเป็น 3 งาน
2.1 งานการเมือง
2.2 งานประสานนโยบายและข้อมูล
2.3 งานเรื่องราวร้องทุกข์

2540 มีโครงสร้างการแบ่งงานออกเป็น 2 ฝ่าย 3 กลุ่มงาน
1. ฝ่ายบริหารงานทั่วไป
2. ฝ่ายเรื่องราวร้องทุกข์และการเมือง
3. กลุ่มประชาสัมพันธ์และวิเทศสัมพันธ์
4. กลุ่มช่วยอำนวยการ
5. กลุ่มระบบข้อมูลและแผนงาน

2546 เปลี่ยนชื่อจากสำนักงานเลขานุการรัฐมนตรี เป็น "สำนักงานรัฐมนตรี" ตามพระราชบัญญัติระเบียบบริหารราชการแผ่นดิน
(ฉบับที่ 5) พ.ศ. 2545 มาตรา 40 และ 41 รวมทั้งพระราชบัญญัติระเบียบบริหารราชการกระทรวงศึกษาธิการ พ.ศ. 2546 มาตรา 10
ได้กำหนดให้สำนักงานรัฐมนตรี เป็นส่วนราชการขึ้นตรงต่อรัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ และจากแนวทางการบริหารราชการยุคใหม่
ของรัฐมนตรี ตามพระราชบัญญัติปรับปรุง กระทรวง ทบวง กรม พ.ศ. 2545 ได้กำหนดบทบาทหน้าที่ของสำนักงานรัฐมนตรี ให้มีฐานะเป็นทีมงานฝ่ายการเมือง มีเป้าหมายเพื่อสนับสนุนการปฏิบัติงานของรัฐมนตรี และของกระทรวงในเชิงยุทธศาสตร์ การวิเคราะห์สถานการณ์ การเชื่อมโยงนโยบายของกระทรวง กับภาพรวมนโยบายของรัฐบาลระดับมหภาค การประสานนโยบายกับกระทรวงต่างๆ ตลอดจนการประสานงานกับฝ่าย
ข้าราชการประจำ เพื่อสนับสนุนรัฐมนตรีในการจัดทำนโยบาย เป้าหมาย และผลสัมฤทธิ์ของกระทรวงที่รัฐมนตรีต้องทำข้อตกลงการทำงาน
กับคณะกรรมการนโยบายของรัฐบาล รวมทั้งการจัดทำรายงานต่อรัฐบาล รัฐสภา และสาธารณชน และเป็นแกนประสานเชื่อมโยงการดำเนินนโยบายรัฐบาลระหว่างกระทรวง

2546-2548 มีโครงสร้างการแบ่งงานออกเป็น 3 กลุ่มงาน
1. งานบริหารทั่วไป
2. กลุ่มงานประสานการเมือง
3. กลุ่มงานสนับสนุนวิชาการ